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Pull down筛靶策略

小分子药靶筛选的Pull down实验是一种有效的筛选药物与潜在靶蛋白之间相互作用的体外技术,Pull down实验基本原理是将小分子药物固定在某种基质上,充当“钓饵”,与蛋白裂解液进行孵育,孵育结束后与化合物结合的蛋白可以通过对基质的分离而分离出来。该方法简单易行,操作方便,在药靶筛选方面已得到广泛的应用。

小分子药靶筛选的Pull down实验是一种有效的筛选药物与潜在靶蛋白之间相互作用的体外技术。利用生物分子之间的亲和力原理,将生物素标记的小分子化合物固定在链霉亲和素的磁珠上,与蛋白裂解液进行孵育,孵育结束后与小分子结合的蛋白可以通过质谱检测,将下游的靶点蛋白鉴定出来。该方法简单易行,操作方便,在药靶筛选方面已得到广泛的应用。

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丨技术优势

  1. 不受结合原理限制,适用范围广

  2. 研究方向明确,筛选到的是与研究方向相关的靶点蛋白

  3. 鉴定到的靶点蛋白数量较多

  4. 可检测到细胞内与小分子结合的靶点蛋白及其互作网络谱

丨经典文章

研究案例1:Pull down +MS筛选苏木酮A的抗炎靶点

2017年7月北京大学屠鹏飞教授团队利用Biotin-SA探针进行Pull down+MS实验“垂钓”苏木酮(SA)的潜在靶点蛋白,发现肌苷单磷酸脱氢酶2(IMPDH2)是SA的关键作用靶点,通过SPR和CETSA实验进一步验证了SA与IMPDH2的直接作用关系,后续通过功能性试验证明了苏木酮A在抗神经炎症方面的作用功效。

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研究案例2:Pull down +MS助力揭示天然代谢物促肿瘤的新机制

国家生物医学分析中心南湖实验室满江红/周涛团队利用Pull down +MS技术鉴定代谢物磷酸肌酸在胶质母细胞瘤干细胞中的互作蛋白。研究发现磷酸肌酸通过靶向结合BRD2,抑制其降解,对胶质母细胞瘤干细胞进行表观遗传重编程,最终加速GBM进展的作用机制。本研究帮助我们深入理解胶质母细胞瘤干细胞的代谢特性,也为GBM的治疗提供了新的思路。

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丨参考文献

[1]. Han D, Zhou T, Li L, et al. AVCAPIR: A Novel Procalcific PIWI-Interacting RNA in Calcific Aortic Valve Disease. Circulation. 2024;149(20):1578-1597. Published 2024 Jan 23.(中国湖北省武汉市华中科技大学同济医学院协和医院 客户文章IF=35.5

[2]. Chen L, Qi Q, Jiang X, et al. Phosphocreatine Promotes Epigenetic Reprogramming to Facilitate Glioblastoma Growth Through Stabilizing BRD2. Cancer Discov. 2024;14(8):1547-1565. Published 2024 Apr 2.(国家生物医学分析中心南湖实验室)IF=29.7

[3]. Liu J, Ren Z, Sun Y, et al. Investigation of the Relationship between Aptamers' Targeting Functions and Human Plasma Proteins. ACS Nano. 2023;17(23):24329-24342. Published 2023 Dec 3.(上海交通大学医学院仁济医院分子医学研究所 客户文章IF=15.8

[4]. Zhang C, Wang H, Liu Q, et al. LncRNA CCAT1 facilitates the progression of gastric cancer via PTBP1-mediated glycolysis enhancement. J Exp Clin Cancer Res. 2023;42(1):246. Published 2023 Sep 23.(河北医科大学第四医院研究中心 客户文章IF=11.4

[5]. Sun Y, Yu D, Geng X, et al. Artificial Base-Directed In Vivo Assembly of an Albumin-siRNA Complex for Tumor-Targeting Delivery. ACS Appl Mater Interfaces. Published  2023 Feb 7.(上海交通大学医学院附属仁济医院分子医学研究所 客户文章IF=8.3 

[6]. Zhou GF, Tang J, Ma YL, et al. ARL6IP1 mediates small-molecule-induced alleviation of Alzheimer pathology through FXR1-dependent BACE1 translation initiation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023;120(22):e2220148120. Published 2023 May 22.(重庆医科大学附属第一医院神经内科 客户文章IF=9.4

[7]. Deng Y, Zeng X, Lv Y, et al. Cdyl2-60aa encoded by CircCDYL2 accelerates cardiomyocyte death by blocking APAF1 ubiquitination in rats. Exp Mol Med. 2023;55(4):860-869. Published 2023 Apr 3.(南京医科大学南京第一医院心脏内科 客户文章IF=9.5

[8]. Luo QW, Yao L, Li L, et al. Inherent Capability of Self-Assembling Nanostructures in Specific Proteasome Activation for Cancer Cell Pyroptosis. Small. 2023;19(9):e2205531. Published 2022 Dec 22.(北京大学药学院 客户文章IF=13.0

[9]. Liang D, Yu C, Ma Z, et al. Identification of anthelmintic parbendazole as a therapeutic molecule for HNSCC through connectivity map-based drug repositioning. Acta Pharm Sin B. 2022;12(5):2429-2442. Published 2021 Dec 20.(山东大学齐鲁医学院药学院化学生物学教育部重点实验室 客户文章IF=14.7

[10]. Liao LX, Song XM, Wang LC, et al. Highly selective inhibition of IMPDH2 provides the basis of antineuroinflammation therapy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017;114(29):E5986-E5994. Published 2017 Jul 18.(北京大学)IF=9.4


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