小分子药靶筛选的Pull down实验是一种有效的筛选药物与潜在靶蛋白之间相互作用的体外技术。利用生物分子之间的亲和力原理,将生物素标记的小分子化合物固定在链霉亲和素的磁珠上,与蛋白裂解液进行孵育,孵育结束后与小分子结合的蛋白可以通过质谱检测,将下游的靶点蛋白鉴定出来。该方法简单易行,操作方便,在药靶筛选方面已得到广泛的应用。
丨技术优势
1. 不受结合原理限制,适用范围广
2. 研究方向明确,筛选到的是与研究方向相关的靶点蛋白
3. 鉴定到的靶点蛋白数量较多
4. 可检测到细胞内与小分子结合的靶点蛋白及其互作网络谱
丨经典文章
研究案例1:Pull down +MS筛选苏木酮A的抗炎靶点
2017年7月北京大学屠鹏飞教授团队利用Biotin-SA探针进行Pull down+MS实验“垂钓”苏木酮(SA)的潜在靶点蛋白,发现肌苷单磷酸脱氢酶2(IMPDH2)是SA的关键作用靶点,通过SPR和CETSA实验进一步验证了SA与IMPDH2的直接作用关系,后续通过功能性试验证明了苏木酮A在抗神经炎症方面的作用功效。
研究案例2:Pull down +MS助力揭示天然代谢物促肿瘤的新机制
国家生物医学分析中心南湖实验室满江红/周涛团队利用Pull down +MS技术鉴定代谢物磷酸肌酸在胶质母细胞瘤干细胞中的互作蛋白。研究发现磷酸肌酸通过靶向结合BRD2,抑制其降解,对胶质母细胞瘤干细胞进行表观遗传重编程,最终加速GBM进展的作用机制。本研究帮助我们深入理解胶质母细胞瘤干细胞的代谢特性,也为GBM的治疗提供了新的思路。
丨参考文献
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