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DARTS非标记筛靶策略

药物亲和反应靶向稳定性技术DARTS (Drug Affinity Responsive Target Stability) 是在 Lomenick 等人于2009 年提出的药物与靶标蛋白结合后可能使靶标具有蛋白酶抗性的特点发展出的小分子靶点筛选技术。DARTS可以使用天然的小分子进行靶点筛选实验,无需对化合物进行生物素标记,降低了实验的复杂度,并节省了实验周期。DARTS不仅可以用于寻找天然产物的潜在药物靶点,还可用于验证已知的小分子与蛋白质的相互作用,是药物与靶点研究的经典技术。

药物亲和反应靶向稳定性技术(Drug Affinity Responsive Target Stability,DARTS)是由美国University of California科研团队于2009年提出的。该方法操作简便,可适用于大多数小分子化合物。DARTS技术是基于蛋白的酶解稳定原理,即小分子与蛋白结合后,可能使蛋白的结构发生解旋或聚集,从而使蛋白对广谱的蛋白酶变得更加耐受或敏感。通过SDS-PAGE分离,进行实验组和对照组的条带比较,最后进行质谱鉴定,即可得到小分子的潜在靶点蛋白。


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丨特点优势

  1. 小分子无需修饰,其构象与活性不产生影响;

  2. 实验原理简单,服务周期短;

  3. 每组3重复,排除个体差异;

  4. 不适于在自然条件下抵抗蛋白质水解的蛋白质或蛋白质结构域。

丨经典文章

研究案例1:DARTS助力揭示天然产物抗肿瘤的新机制

上海中医药大学张卫东教授团队采用cMAP预测联合DARTS技术,发现水仙环素(Narciclasine)的靶点蛋白STAT3,通过MST与分子对接实验进一步验证了水仙环素与STAT3的直接作用关系。最后通过功能性实验证实了水仙环素能够与STAT3结合发挥抗肿瘤作用。

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研究案例2:外泌体+DARTS发现人参皂苷Rb1对结直肠癌的治疗作用

上海中医药大学曙光医院联合了药物靶点和外泌体机制两大研究热点,发现携带circ-0034880的外泌体可以促进结直肠癌的肝转移,随后筛选到了能够显著抑制该环状RNA表达的中药活性成分人参皂苷Rb1。进一步采用DARTS技术鉴定到了人参皂苷Rb1的作用靶点是与环状RNA生物发生相关的蛋白QKI。通过CETSA和SPR方法验证了二者间的相互作用。最后体内功能实验证明了Rb1预处理的肿瘤细胞来源的外泌体失去了促进癌症肝转移的作用。

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丨参考文献

[1]. Zhou J, Song Q, Li H, et al. Targeting circ-0034880-enriched tumor extracellular vesicles to impede SPP1highCD206+ pro-tumor macrophages mediated pre-metastatic niche formation in colorectal cancer liver metastasis. Mol Cancer. 2024;23(1):168. Published 2024 Aug 20.(上海中医药大学附属曙光医院 客户文章IF=27.7

[2]. Ni J, Zhang L, Feng G, et al. Vanillic acid restores homeostasis of intestinal epithelium in colitis through inhibiting CA9/STIM1-mediated ferroptosis. Pharmacol Res. 2024;202:107128. Published 2024 Mar 2(复旦大学)IF=9.1

[3]. Chen H, Hu Q, Wen T, et al. Arteannuin B, a sesquiterpene lactone from Artemisia annua, attenuates inflammatory response by inhibiting the ubiquitin-conjugating enzyme UBE2D3-mediated NF-κB activation. Phytomedicine. 2024;124:155263. Published 2023 Dec 14(成都中医药大学附属医院)IF=6.7

[4]. Jia W, Liang S, Jin M, et al. Oleanolic acid inhibits hypoxic tumor-derived exosomes-induced premetastatic niche formation in hepatocellular carcinoma by targeting ERK1/2-NFκB signaling. Phytomedicine. 2024;126:155208. Published 2023 Nov 11.(海军军医大学第一附属医院 客户文章IF=6.7

[5]. Meng WS, Sun J, Lu Y, et al. Biancaea decapetala (Roth) O.Deg. extract exerts an anti-inflammatory effect by regulating the TNF/Akt/NF-κB pathway. Phytomedicine. 2023;119:154983. Published 2023 Jul 17.(贵州医科大学)IF=6.7

[6]. Tan XP, He Y, Yang J, et al. Blockade of NMT1 enzymatic activity inhibits N-myristoylation of VILIP3 protein and suppresses liver cancer progression. Signal Transduct Target Ther. 2023;8(1):14. Published 2023 Jan 9.(广州医科大学第五附属医院)IF=40.8


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