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CETSA热稳定筛靶策略

细胞热转移技术(CETSA)是基于蛋白的热稳定性原理,即小分子与靶点蛋白结合后增强靶点蛋白的热稳定性,相同温度下,未降解蛋白的量会提高,该复合蛋白的热熔曲线发生改变,进一步通过质谱鉴定到小分子的潜在靶点蛋白。

细胞热转移技术(Cellular Thermal Shift Assay,CETSA)是2013年由瑞典Karolinska研究所团队研发的一项实验技术。该技术基于蛋白的热稳定性原理,即小分子与靶点蛋白结合后会增强靶点蛋白的热稳定性。随着温度的升高,部分蛋白会逐渐降解。相同温度下,结合了药物的蛋白质具有更高的热稳定性,相比未结合药物的蛋白质,未降解蛋白的量会提高,同时该复合蛋白的热熔曲线发生改变,进一步通过质谱鉴定到小分子的潜在靶点蛋白。

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丨 特点优势

  1. 小分子无需修饰,其构象与活性不产生影响;

  2. 实验原理简单,服务周期短;

  3. 需要提供靶细胞,研究方向明确;

  4. 不适用于在自然条件下耐温的蛋白质。

丨 研究案例

研究案例1:CETSA+MS助力揭示天然产物缓解神经性疼痛的新机制

2023年中国医学科学院药物研究所庾石山团队利用CETSA+MS(TPP)技术,鉴定到木藜芦烷毒素Rho的主要靶点蛋白N-乙基马来酰亚胺敏感融合蛋白 (NSF) ,通过ITC与分子对接实验进一步验证了二者的的直接作用关系。结果表明Rho通过抑制NSF介导的Cav2.2钙通道跨膜运输缓解神经性疼痛。

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研究案例2:CETSA+MS筛选抗疟疾药物蒿甲醚改善脂代谢的潜在靶点

2024年北大药学院曾克武教授和屠鹏飞教授团队,使用TPP技术联合CMAP分析鉴定出了118个潜在的青蒿素衍生物蒿甲醚(ART)结合蛋白。发现ART通过直接靶向PKCδ,阻断锌指DHHC型棕榈酰转移酶5(ZDHHC5)的结合,抑制PKCδ的棕榈酰化修饰从而改善脂代谢紊乱。接下来,CETSA实验、pull down实验和DARTS实验均证实了PKCδ是ART的直接靶点。Pull down实验表明ART与独特的PKCδ的C1结构域特异相互作用。研究结果表明下丘脑小胶质细胞PKCδ的棕榈酰化可能通过下丘脑-肝脏通讯调节外周脂肪代谢。

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丨 参考文献

[1]. Ni J, Zhang L, Feng G, et al. Vanillic acid restores homeostasis of intestinal epithelium in colitis through inhibiting CA9/STIM1-mediated ferroptosis. Pharmacol Res. 2024;202:107128. Published 2024 Mar 2.(复旦大学)IF=9.1

[2]. Qu J, Qiu B, Zhang Y, et al. The tumor-enriched small molecule gambogic amide suppresses glioma by targeting WDR1-dependent cytoskeleton remodeling. Signal Transduct Target Ther. 2023;8(1):424. Published 2023 Nov 8.(北京协和医院)IF=40.8

[3]. Wang Y, Zhao J, Xu Y, et al. Uncovering SOD3 and GPX4 as new targets of Benzo[α]pyrene-induced hepatotoxicity through Metabolomics and Chemical Proteomics.  Redox Biol. 2023;67:102930. Published 2023 Oct 11.(浙江大学)IF=10.7

[4]. Fang Z, Xu Y, Liu G, et al. Narirutin activates TFEB (transcription factor EB) to protect against Acetaminophen-induced liver injury by targeting PPP3/calcineurin. Autophagy. 2023;19(8):2240-2256. Published 2023 Feb 24.(吉林大学)IF=14.6

[5]. Dong X, Lu S, Tian Y, et al. Bavachinin protects the liver in NAFLD by promoting regeneration via targeting PCNA. J Adv Res. 2024;55:131-144. Published 2023 Feb 16.(中国医学科学院北京协和医学院)IF=11.4

[6]. Chen K, Wang T, Li Y, et al. Rhodojaponin VI indirectly targets Cav2.2 channels via N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein to alleviate neuropathic pain. Acta Pharm Sin B. 2023;13(3):1326-1336. Published 2023 Feb 3.(中国医学科学院北京协和医学院)IF=14.7



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