基于活性的蛋白质组学分析技术ABPP（Activity-Based Protein Profiling）是在点击化学和LC-MS质谱基础上发展起来的小分子化合物靶点蛋白筛选技术。将小分子进行炔基标记后处理细胞，通过简便高效的点击化学反应，将结合上靶点蛋白的炔基小分子连接到带有叠氮的磁珠上，通过磁珠离心获取小分子靶向结合的靶点蛋白。进一步，通过LC-MS分析出小分子的潜在靶点蛋白。

丨 技术优势

  1. 炔基修饰对小分子的活性和结构影响小，几乎不干扰小分子原本的生物活性

  2. 炔基标记的小分子可在活细胞水平上进行靶点筛选

  3. 研究方向明确，筛选到的是与研究方向相关的靶点蛋白

  4. 拥有完整的小分子炔基标记体系

丨 研究案例

研究案例1：ABPP筛选天然产物野马追内酯B抗癌靶点

南方科技大学第一附属医院联合中国医学科学院研究团队利用炔基标记天然产物野马追内酯B（EB），合成了保留原有抗三阴乳腺癌活性的小分子探针，并利用ABPP技术筛选EB的靶点蛋白。实验结果显示，EB通过靶向BCAT1介导的BCAA代谢抑制SHOC2/RAS/ERK激活，最终抑制癌细胞增殖并促进细胞凋亡。本研究发现了三阴乳腺癌的治疗新靶标，为其临床新药开发提供了新的思路。

研究案例2：ABPP筛选天然化合物BVC促进肝脏再生作用靶点

中国协和医学院/中国医学科学院药用植物研究所孙晓波教授团队利用ABPP技术，分析并鉴定了中药补骨脂中的活性成分Bavachinin（BVC）的作用靶点，以探究其发挥保肝作用的机制。结果显示，增殖细胞核抗原（PCNA）是BVC的潜在靶点，进一步的DARTS、CETSA和SPR实验也证明了二者间的相互作用。研究结果表明，BVC通过靶向PCNA促进肝脏再生，从而改善非酒精性脂肪性肝病。

丨 参考文献

[1]. Huang L, Li G, Zhang Y, et al. Small-molecule targeting BCAT1-mediated BCAA metabolism inhibits the activation of SHOC2-RAS-ERK to induce apoptosis of Triple-negative breast cancer cells. J Adv Res. S2090-1232(24)00476-4. Published 2024 Oct 28.（南方科技大学第一附属医院联合中国医学科学院）IF=11.4

[2]. Dong X, Lu S, Tian Y, et al. Bavachinin protects the liver in NAFLD by promoting regeneration via targeting PCNA. J Adv Res. 2024;55:131-144. Published 2023 Feb 16.（中国医学科学院北京协和医学院）IF=11.4

[3]. Zheng ZG, Xu YY, Liu WP, et al. Discovery of a potent allosteric activator of DGKQ that ameliorates obesity-induced insulin resistance via the sn-1,2-DAG-PKCε signaling axis. Cell Metab. 2023;35(1):101-117.e11. Published 2023 Jan 3.（中国药科大学）IF=27.7

[4]. Yang W, Mu B, You J, et al. Non-classical ferroptosis inhibition by a small molecule targeting PHB2. Nat Commun. 2022;13(1):7473. Published 2022 Dec 3.（四川大学）IF=14.7

[5]. Carvalho LAR, Ross B, Fehr L, et al. Chemoproteomics-Enabled Identification of 4-Oxo-β-Lactams as Inhibitors of Dipeptidyl Peptidases 8 and 9. Angew Chem Int Ed Engl. 2022;61(47):e202210498. Published 2022 Oct 28.（里斯本大学）IF=16.1

[6]. Gao P, Liu YQ, Xiao W, et al. Identification of antimalarial targets of chloroquine by a combined deconvolution strategy of ABPP and MS-CETSA. Mil Med Res. 2022;9(1):30. Published 2022 Jun 14.（中国中医科学院中药研究所）IF=16.7

[7]. Wei J, Chen X, Li Y, et al. Cucurbitacin B-induced G2/M cell cycle arrest of conjunctival melanoma cells mediated by GRP78-FOXM1-KIF20A pathway. Acta Pharm Sin B. 2022;12(10):3861-3876. Published 2022 May 23. （华东理工大学）IF=14.7

[8]. Luo P, Zhang Q, Zhong TY, et al. Celastrol mitigates inflammation in sepsis by inhibiting the PKM2-dependent Warburg effect. Mil Med Res. 2022;9(1):22. Published 2022 May 20.（中国中医科学院中药研究所）IF=16.7

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