限制性酶解-质谱分析技术LiP-MS （Limited proteolysis-coupled mass spectrometry）是一种基于有限蛋白酶切的化合物靶点筛选技术，其独特之处在于无需对化合物进行修饰即可实现对特定化合物结合肽段进行筛选。小分子与蛋白质相互作用后，利用两种蛋白酶交叉切割，最后利用质谱技术分析酶解的多肽产物，通过数据分析比对两种酶作用后产生的多肽及位点的不同，鉴定出能够与小分子结合的特定肽段，从而确定小分子结合的靶点蛋白。

丨 技术优势

  1. 无需对小分子进行修饰，避免了因修饰可能导致的小分子活性改变，服务周期短

  2. 能够筛选到小分子与靶点蛋白结合的肽段，可进行个性化数据分析

  3. 实验设置每组3重复，排除个体差异

  4. 更适用于代谢产物及小分子量化合物的靶点筛选研究

丨 技术优势

研究案例1：LiP-MS技术绘制代谢物-蛋白相互作用图谱

苏黎世联邦理工学院2018年发表在Cell上的文章首次利用LiP-MS技术系统的绘制了代谢物的蛋白结合谱，鉴定出三羧酸循环中大多数代谢物的靶点蛋白。在天然细胞基质中直接进行的代谢物-蛋白质相互作用和结合位点的系统分析，并确定了二者结合后靶点蛋白整体构象发生变化的的原因。

研究案例2：LiP-MS技术揭示L-精氨酸调控T细胞代谢、生存及抗肿瘤活性的机制

该团队在Cell上发表的另一篇文章探究了L-精氨酸调控T细胞分化、存活能力的分子机制。首先作者通过代谢组和蛋白质组发现精氨酸代谢变化导致细胞内精氨酸浓度下降。进一步利用LiP-MS技术鉴定到了L-精氨酸的靶点蛋白BAZ1B、PSIP1和TSN，它们均为转录因子，调控了L-精氨酸依赖的T细胞重编程过程，进一步增加了细胞的生存能力。

丨 参考文献

[1]. Zhang QQ, Chen QS, Feng F, et al. Benzoylaconitine: A promising ACE2-targeted agonist for enhancing cardiac function in heart failure. Free Radic Biol Med. 2024;214:206-218. Published 2024 Feb 16.（同济大学）IF=7.1 

[2]. Khanppnavar B, Schuster D, Lavriha P, et al. Regulatory sites of CaM-sensitive adenylyl cyclase AC8 revealed by cryo-EM and structural proteomics. EMBO Rep. 2024;25(3):1513-1540. Published 2024 Feb 13. （保罗·谢尔研究所）IF=6.5

[3]. Capuano A, D'Urso G, Aliberti M, et al. Chemoproteomics Reveals USP5 (Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 5) as Promising Target of the Marine Polyketide Gracilioether A. Mar Drugs. 2024;22(1):41. Published 2024 Jan 11. （意大利萨勒诺大学）IF=4.9

[4]. Kim D, Lee MS, Kim ND, Lee S, Lee HS. Identification of α-amanitin effector proteins in hepatocytes by limited proteolysis-coupled mass spectrometry. Chem Biol Interact. 2023;386:110778. Published 2023 Oct 23. （韩国天主教大学）IF=4.7

[5]. Paukštytė J, López Cabezas RM, Feng Y, et al. Global analysis of aging-related protein structural changes uncovers enzyme-polymerization-based control of longevity. Mol Cell. 2023;83(18):3360-3376.e11. Published 2023 Sep 11. （苏黎世联邦理工学院生物化学研究所）IF=14.5

[6]. Piazza I, Kochanowski K, Cappelletti V, et al. A Map of Protein-Metabolite Interactions Reveals Principles of Chemical Communication. Cell. 2018;172(1-2):358-372.e23. Published 2018 Jan 4. （苏黎世联邦理工学院）IF=45

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